药物流产孕囊排出后大部分不需要清宫，但10%左右会有残留，如果残留较大需要清宫，所以药物流产看到孕囊排出后，并不能100%说明药流成功，成功率一般在90%左右，还有10%会发现残留较多，需要做手术。药流第一天服用米非司酮，是孕激素拮抗剂，可以使胚胎松动，第三天服用米索前列醇，是宫缩剂，将松动的孕囊排出体外，一般服用米索后几个小时通常可以看到孕囊排出，孕囊排出后孕囊周围包绕的蜕膜组织并没有排出，是药物流产与人工流产的主要区别之一。
遗留的蜕膜组织需要自行吸收，但药流后给予益母草等缩宫药物，也有一定的促蜕膜排出的作用，90%左右的蜕膜可以排干净，但有10%蜕膜排不干净，药物流产后2周要常规复查B超，B超提示宫腔有较多残留，则需要手术清宫。
