脑干出血是一种比较特殊的自发性脑出血，它的部位位于生命中枢，这个部位的出血会导致较深的昏迷，甚至可能因生命中枢的功能紊乱，出现呼吸、血压、脉搏的不稳定，在这个情况下，所有的处理方式都非常棘手。
针对脑干出血引起的急性梗阻性积水，可以行脑室穿刺，缓解急性梗阻性脑积水疾病的症状，从而缓解颅内高压。而针对血肿本身的处理，只要呼吸、血压、脉搏的生命体征能够保持平稳，就有手术时机，这个手术采取的方式，一般是脑内血肿穿刺，以微创的形式进行，不适合大范围的开颅手术，这样手术才能安全完成。