胆囊萎缩并不会引起肝癌。胆囊萎缩属于胆囊癌的高危因素，针对胆囊萎缩建议还是尽早给予手术治疗，特别是当胆囊萎缩内部还合并有充满型的胆囊结石，或者胆囊壁的明显增厚，针对这种情况更是建议要早期给予手术切除，才能预防后期出现胆囊癌的风险。
肝癌包括原发性肝细胞癌、肝胆管细胞癌、转移性肝癌，其中以原发性肝细胞癌最为常见，大约占80%。肝癌的主要高危因素就是乙肝、酒精肝以及自身免疫性肝病、肝硬化。需要注意胆囊萎缩如果出现相关的癌变即胆囊癌，可能胆囊癌也会转移到肝脏，从而引起转移性肝癌。
另外因为胆囊位于肝脏的下方，所以当胆囊萎缩出现严重的胆囊癌，也可能通过直接蔓延的情况下，直接生长进入肝脏，从而形成相应的侵犯。所以针对这种情况下，胆囊萎缩并发胆囊癌，就有可能会形成转移性肝癌。
