诊断多囊卵巢，做B超时间安排在基础状态较好，即来月经第2-5天带着月经做，因为此时做较能代表卵巢基础状态，亦不受后面有囊肿或者卵泡影响。但大多数有多囊卵巢综合征患者，即使不在月经第2-5天，不在此基础状态，平时时间做B超，仍绝大多数女性可以看到一侧或者双侧卵巢存在2-9mm卵泡，个数超过12个，亦可以明确诊断。只是建议安排在来月经第2-5天做B超，明确诊断较好，而不是在其他时间不能做B超。
此外想诊断多囊卵巢综合征，并不是单纯凭B超结果就能明确诊断，同时根据病史，比如月经紊乱、月经稀发或者闭经等必要条件，才能诊断多囊卵巢综合征。然后有B超支持或者有高雄激素血症表现、高雄激素症状等，综合诊断是多囊卵巢综合征，不能单纯看B超即多囊卵巢综合征。
