下丘脑损伤是临床上比较严重的状况，很难彻底治愈，而且患者预后很差。下丘脑是人体重要的中枢部位，控制人体的睡眠、觉醒，影响垂体的内分泌功能，还是体温调节中枢，影响人体循环、消化等诸多系统的功能。所以下丘脑损伤之后，患者常会出现比较持久而严重的昏迷，可能会由于影响到垂体功能，进而影响整个内分泌轴，造成严重的水电解质紊乱、尿崩症等症状。另外，还可能会造成患者体温调节的失调，引起严重的中枢性高热，使脑部的损伤进一步加重。

由于下丘脑影响人体的循环乃至消化系统，所以患者还容易出现循环系统并发症，以及应激性溃疡等一系列的并发症和后遗症。而且下丘脑损伤很少单独存在，对于原发性下丘脑损伤的患者，常合并脑干损伤和脑挫裂伤等其它类型的脑损伤。而对于继发下丘脑损伤的患者，常发生于脑疝等病情非常危重时。因此，无论是原发性下丘脑损伤，还是继发性下丘脑损伤，都是临床上比较严重的状况，很难彻底治愈，患者的病死率很高。