输尿管软镜碎石手术的副作用，即手术并发症或手术相关的风险。手术本身便存在风险或手术可能会对患者造成创伤，目前随着微创技术的发展，输尿管软镜碎石手术是通过尿道，将输尿管软镜插入到肾脏中而寻找肾脏内的结石，将结石击碎而便于结石排出，其副作用主要与以下方面有关：

1、与患者本身病情有关：即与患者的结石负荷、大小、数量有一定关系，或结石本身所导致的危害，比如肾结石是否引起严重梗阻，而出现严重肾积水等副作用。如果为单发结石或较小的结石，输尿管软镜碎石手术的效果较好，且手术的副作用较小；

2、与软镜手术本身有关：比如进行输尿管软镜碎石手术后，由于输尿管软镜是将软镜通过尿道进入肾脏，患者的肾脏属于一个密闭空间，医生在碎石过程中需不断向肾脏内冲水，水的压力到一定程度，如果患者尿液或结石本身来源于感染性原因，术后的感染风险较高，比如患者可出现发烧的情况；

3、与手术本身有关：无论患者是进行软镜或硬镜手术，术后均需放置支架管，患者在术后可能出现支架管刺激等相关的副作用，该副作用与软镜本身并无较大关系；

4、与结石排出效果有关：即治疗效果，如果患者的输尿管较细，或结石数量较多，即便通过手术将结石击碎，术后的排石效果也可能因人而异。有些可能手术后结石排出的效果并不理想，比如结石排不干净，或结石引起尿路梗阻等，有些患者可能手术效果较好。