二代试管婴儿和一代试管婴儿相比，并不会增加胎儿或婴儿患脑瘫的几率。一代试管婴儿和二代的试管婴儿唯一的不同，是受精方式的不同，对于女性在取卵之前，所使用的超速排卵方案、取卵方式以及胚胎培养方式，其实都一样，只是在受精的时候，二代试管婴儿使用的是显微受精，主要是由因为男方精液参数特别差，精子数量不够完成一代试管婴儿受精。一代试管婴儿对男方精液参数的要求比较高，所需要的精子总数也会更多，所以二代试管婴儿适合男性精液参数特别差，或一代试管婴儿无法受精的情况。
二代试管婴儿跟一代试管婴儿相比，并不增加胎儿或婴儿某些疾病的发病率，也不会增加脑瘫的发病率。导致脑瘫的因素有很多，包括先天性因素和孕期中的因素，怀孕过程中有较多的因素，都会增加脑瘫的几率，分娩过程中胎儿缺氧，也会增加脑瘫的几率，所以脑瘫并不是二代试管婴儿和一代试管婴儿的原因。
