角膜刮片发现存在菌丝，说明为真菌性角膜炎，即角膜炎由真菌感染造成，能帮助临床医生确定病因。角膜刮片发现发现菌丝的临床检验非常简单有效，对真菌性角膜炎的阳性率及确诊率达到95%以上，比共焦显微镜发现菌丝阳性率高，共焦显微镜发现菌丝阳性率维持在30%，甚至<30%。
真菌性角膜炎典型的临床特点是症征分离，即症状和体征二者相互分离的现象。临床医生通常可以发现患者存在严重体征即角膜溃疡，存在圆形的白色溃疡灶，甚至有黏稠的前房积脓、角膜溃疡穿孔，但患者疼痛、畏光或流泪等临床症状不严重。真菌性角膜炎另一个特点是秋收夏忙时，农民在收庄稼时植物划伤角膜，此时容易发生真菌性角膜炎。
