尿液中如果上皮计数升高，要明确上皮细胞的类型，因为尿液中上皮细胞是来源于肾盂到尿道外口整个泌尿系统的上皮，类型不同代表的临床意义不相同。尿液中上皮细胞可分为肾小管上皮细胞、移行上皮细胞和复层扁平上皮细胞。肾小管上皮细胞主要来源于远曲和近曲肾小管，在尿液中出现往往提示肾小管病变。在肾移植患者当中监测肾小管上皮细胞，主要是监测有无排斥反应。
移行上皮细胞可分为三层，表层移行上皮细胞来源于膀胱，中层移行上皮细胞来源于肾盂，而底层移行上皮细胞来源于输尿管、膀胱和尿道。如果是正常尿液，没有移行上皮细胞，移行上皮细胞在尿液中出现的时候，最常见的原因是泌尿系统感染，如果大量出现，需要警惕有没有移行细胞癌。
复层扁平上皮细胞又叫鳞状上皮细胞，主要位于尿道前端，女性可能混合有来自阴道的复层扁平上皮细胞。如果在尿液中出现复层扁平上皮细胞，同时有白细胞，甚至脓细胞的时候，考虑有尿道炎的可能。
