脑干肿瘤源于脑干的最常见的是胶质瘤，它是基因突变的结果，源于身体内的免疫失衡。正常情况下人体内癌基因和抑癌基因相互抑制，协同作用，癌基因起到组织修复增生的作用，比如身上的某些器官组织有损伤、出血，修复需要癌基因，但修复平整后抑癌基因启动，但有时免疫失衡之后，抑癌基因在该发挥作用的时候不能够发挥作用，即无法阻止癌基因的异常增生，它就会无限增殖，越长越大，从而形成肿瘤。
脑干肿瘤种最常见的是胶质瘤，星形细胞瘤或者胶质母细胞瘤，属于恶性肿瘤，如果不是在非常重要的功能区，可以通过手术切除，然后根据情况随访。如果病理级别比较高，恶性度高，要配合以放化疗。如果在重要的生命功能区，比如在延髓，呼吸心跳会受到很大影响，所以有时要取活检证明它的病理来源，然后进行相应的放疗和化疗。
