卵巢黏液性囊腺癌初始治疗包括全面手术加术后治疗或观察，对于怀疑或确诊为卵巢黏液性囊腺癌的患者，需要切除阑尾。对于Ⅰ期未完成生育者，可以考虑接受保留生育功能的手术。对于ⅠA和ⅠB期患者，术后可以选择观察，也可以进行随访。对于ⅠC期患者，术后可以选择观察，也可以选择化疗。但对于Ⅱ期和Ⅳ期患者，术后应该选择上皮性卵巢癌化疗方案进行化疗。
卵巢黏液性囊腺癌如果能在早期明确诊断，预后相对十分理想，患者五年生存率可以达到80%-90%。黏液性囊腺癌好发于20-40岁年轻女性，通常情况下肿瘤体积很大，可以早期发现，有的可以占满整个盆腔。对于卵巢黏液性囊腺癌患者，需要对胃肠道进行评估并检测CA19-9，从而排除隐匿于胃肠道原发肿瘤转移到卵巢。胃肠道肿瘤转移到卵巢更为常见，但在病理上比较难以鉴别。
