甲状腺是非常重要的内分泌腺体，所分泌的甲状腺激素的作用跟大脑的发育有明确相关性。每个人都有免疫系统，但是免疫系统在年轻的时候可能会出错，比如无法识别甲状腺某些成分，如甲状腺球蛋白或者甲状腺的微粒体，对其产生免疫反应、产生抗体，这种抗体叫甲状腺抗体。
临床常对甲状腺球蛋白抗体和甲状腺微粒体抗体进行监测，促甲状腺激素受体抗体也是引起甲亢很重要的自身免疫指标。这些抗体指标，如果经过一段时间的自身缓解或者是某些药物的治疗，抗体水平下降，可能间接提示自身免疫反应得到一定的缓解。目前临床所监测的各种甲状腺自身抗体，很少能够通过比如药物或者是食物起到明显下降作用。往往这种自身抗体的下降，可能跟患者自身免疫功能改善相关。因此甲状腺自身抗体的下降代表着甲状腺功能损伤减少或者病情的缓解。
