过敏性结膜炎和细菌性结膜炎的鉴别比较容易，常见的鉴别方式有以下几种：

1、临床表现：过敏性结膜炎表现主要是眼睛痒，但没有分泌物，而且结膜充血也较轻，只表现为轻度结膜充血或混合充血。细菌性结膜炎患者的结膜充血比较明显，同时表现为白色或黄白色的脓样分泌物，患者有时会有结膜水肿，同时睑结膜上有乳头或滤泡增生；

2、病因：过敏性结膜炎和细菌性结膜炎的病因不同，过敏性结膜炎是过敏原刺激结膜组织引起的变态反应，而细菌性结膜炎是由于细菌引起的结膜感染性炎症；

3、治疗方法：由于病因不同，所以二者的治疗方法也有所不同。过敏性结膜炎的治疗方法主要在于祛除过敏原，同时还可以应用非甾体类消炎药、抗组胺药、肥大细胞稳定剂、激素以及冷敷。而细菌性结膜炎通常会使用抗菌素眼药水，一般不建议患者进行理疗，即冷敷或热敷。

过敏性结膜炎和细菌性结膜炎在临床上虽然比较容易鉴别，但是有时由于过敏性结膜炎眼睛比较痒，患者会不由自主揉眼睛，将手上的细菌带上眼睛，因此可以导致过敏性结膜炎合并细菌性结膜炎。患者表现为眼睛痒、结膜充血明显，而且眼睛内有较多脓性分泌物，上述症状可能同时出现，因此对于此类患者会同时用药，此时建议患者在医生指导下正确用药。