急性肾盂肾炎的诊断，主要是根据病人有腰痛、发热、尿频、尿急、尿痛等临床症状，查体时有肾区叩击痛，检查可以看到病人尿中有红细胞、白细胞、细菌等，就可以进行诊断。
急性肾盂肾炎的发病通常比较急，这时病人往往会有寒战、高热，体温可以超过39℃，甚至超过40℃。另外，病人会有腰痛，往往是比较剧烈的疼痛。查体时可以发现有肾区叩击痛，有可能会出现肋脊点、肋腰点的压痛。
除此之外，做化验检查时，还会发现尿中有白细胞、红细胞，甚至尿中可以看到细菌。通过这些可以进行初步诊断，但是要明确诊断，还需要做尿培养，发现有细菌生长，才能诊断急性肾盂肾炎。
做尿培养时，一般的细菌要求数量在10^5，如果一些少见的细菌，数量在10^4，才能够诊断急性肾盂肾炎。
