免疫功能的检测通常要检查人体的细胞免疫及体液免疫，这两项指标为基准的检测指标。通过此两项可见患者体内的IgG、IgA、IgE、IgM等抗体水平，用于观察患者是否有免疫系统功能失调，或免疫系统功能受损的多项检查指标。同时对于免疫系统功能检测，还应该包括患者若既往患免疫系统疾病，包括系统性红斑狼疮、风湿热、类风湿性关节炎，可以针对这类患者，进行特殊的免疫学检测，包括抗核抗体、抗Sm抗体、抗dsDNA抗体。这类检测可测出患者的免疫学功能和免疫学指标的参数，用于检测患者是否有部分免疫原性疾病。
如果患者既往有风湿病，应该做风湿系列监测，包括抗O试验、风湿抗体、类风湿抗体、血沉，这类指标也属于免疫功能检测的涵盖项目。对于部分有条件的患者，应该尽量检测生化系列指标，包括检查患者的内分泌系统、血常规、尿常规、肝肾功能，可以间接判定一定的免疫功能水平。
