男人肾囊肿一般不会影响生育。肾囊肿是由膨大的肾小管不断生长而成，膨大的肾小管不停生长，生长速度有快有慢。
如果病人肾囊肿超过4cm，而且向内生长，这时考虑进行干预。最常用的方法就是穿刺，把囊液抽出再把硬化剂打进去，还有去顶减压。如果怀疑有囊性肾癌，还要进行囊肿切除等。
肾囊肿通常不会影响肾功能，除非发生了多囊肾的情况，即便影响肾功能，轻微的肾功能不全也不会影响生育。
如果肾囊肿影响肾功能比较严重，病人出现严重肾功能不全，甚至达到尿毒症期。尿毒素在体内蓄积影响人体全身系统，也会影响生殖系统，可能出现精子活力低或数量少等，可能影响生育。
