怀孕5周是否可以药流，取决于B超检查的结果。若女性在怀孕5周时B超未观察到明显的妊娠囊，则不建议进行药流，因为此时无法完全除外宫外孕的可能性。若妊娠囊较为明确，已经确诊为宫内孕，则可以进行相关的药物流产。药物流产的条件包括停经天数≤49天，孕产妇的年龄≤40岁以及B超明确诊断为宫内孕，此时才能进行药物流产。若在怀孕5周时未明确胎囊的存在，则可在6-7周复查B超，确定为宫内孕后再进行药物流产。
进行药物流产前还需进行术前准备，除心电图、B超外还需要进行血常规的检查以了解女性凝血、血小板、血色素以及白细胞的情况。此外，还需进行肝肾功能的检查，由于药物流产使用的药物会对肝肾功能造成损害，若已经处于肝肾功能损害的急性期则不建议进行药物流产。
