引起女性雌激素降低既有生理因素，也有某些疾病。雌激素是由卵巢分泌，卵泡在长大过程中会不断成熟并分泌雌二醇、雌激素。
卵巢的工作受到上级管理部门下丘脑和垂体支配，因此不同部位出了问题都有可能造成雌激素水平降低，如下所示：
一、生理因素：
主要是年龄增加后卵巢功能会逐渐减退，由于卵泡逐渐消耗殆尽，卵泡减少后雌激素的来源自然减少，生理性因素中更年期最重要。
二、疾病因素：
1、卵巢疾病：如果卵巢出了疾病，比如出现炎症、肿瘤甚至手术切除等也可造成女性卵巢功能减退，出现雌激素分泌减少。像40岁之前卵巢早衰或者卵巢储备功能不足等都是引起女性雌激素减少的病因；
2、下丘脑、垂体疾病：比如手术创伤，自身免疫性的炎症、感染使得垂体功能减退，垂体分泌的促性腺激素，包括黄体生成素、卵泡刺激素、促性腺激素分泌减少，同样会造成继发性的女性卵巢功能减退，雌激素合成会明显降低。
