任何手术都有风险，子宫肌瘤的手术同样也充满风险。子宫肌瘤手术大体分为子宫肌瘤剔除和全子宫切除两类，手术路径分为普通的开腹手术以及腹腔镜手术、经阴道手术等微创术式，无论何种手术方法、手术途径都有一定的风险。一般子宫肌瘤剔除术相对简单，风险较小，但是有时也有术后血肿形成，继发感染的风险。极个别情况下，子宫周围有致密粘连，在分离粘连时，有时甚至也会出现副腹伤，比如损伤肠管、输尿管、膀胱等。
但是肌瘤剔除术副损伤相对少见，全子宫切除术副损伤相对常见。子宫切除术最常见的术后并发症仍然是局部血肿形成，继发感染，有时会出现严重的手术并发症，主要指肠管损伤或泌尿系损伤，包括输尿管损伤、膀胱损伤。如果术中没有及时发现损伤，未及时给予修补，会形成术后的尿瘘、粪瘘，非常痛苦，需要二次手术修补。
