部分患者由于各种原因在取卵周期不能进行移植，会将已经形成的胚胎利用胚胎冷冻技术冻存起来，等待以后的冻胚进行移植。冻胚移植的时间选择，一般根据促排卵方案，及卵巢刺激后恢复状况来决定。如果用常规的降调节长方案，因为应用降调节药物加上促排卵的用药量比较大，卵巢大多数是多卵泡发育，体积也相应增大，则恢复起来的时间就相对较慢，所以建议取卵周期后的第三次月经再进入冻胚移植周期。
而对于拮抗剂方案，由于没有降调节的过程，对于自身内分泌干扰比较小，而且促排卵的药物剂量比较少，自身内分泌变化不大，卵巢体积增大不是很明显，所以恢复起来相对比较快，在取卵后的第二次月经就可以准备做冻胚移植。而微刺激周期促排卵的药物用的是最少，基本上是模拟自然周期，所以在取卵后的第一次月经就可以预约冻胚移植。
总之，冻胚移植的时机选择因人而异，根据促排卵方案、卵巢恢复大小等情况而定。促排卵方案越简单、用的药物越少，内分泌和卵巢恢复时间越短，冻胎移植的等待时间也越短。
