甲状腺自身抗体指由于身体自身免疫系统失调产生的针对甲状腺某些成分的免疫球蛋白，这种抗体可以对甲状腺造成一定破坏。一般情况下，甲状腺自身抗体升高提示自身免疫性甲状腺疾病。甲状腺自身抗体种类较多，最常见两大类，一类是针对甲状腺细胞膜促甲状腺激素受体的抗体，称为TSH受体抗体，包括对甲状腺起刺激作用的抗体TS-Ab和起抑制作用的抗体TB-Ab两大类。其中TS-Ab的临床价值更大，升高的TS-Ab提示有自身免疫性甲状腺机能亢进症，是Graves病诊断的重要指标。Graves病治疗后，如果仍然有较高水平的TS-Ab提示停药以后的复发率高。

另一类抗体是针对甲状腺细胞内容物甲状腺球蛋白和过氧化物酶的抗体，称为甲状腺球蛋白抗体TG-Ab和过氧化物酶抗体TPO-Ab。其与慢性淋巴细胞性甲状腺炎、桥本甲状腺炎发病有密切关系，同时持续升高的TG-Ab和TPO-Ab提示日后发生甲状腺功能减退的风险增加。但是非特异性甲状腺损伤、甲状腺肿和甲状腺癌等多种甲状腺疾病中，甚至少数健康人群中也能测到TG-Ab和TPO-Ab轻度升高，因此临床意义比较复杂。如果抗体水平升高，必须请临床医生结合临床症状、临床表现或者其它实验室检查进行综合判断。