桥本甲减是桥本甲状腺炎引起的甲状腺功能减退，治疗就是要针对甲状腺功能减退补充药物。标准的治疗是每天使用合成的甲状腺激素即左甲状腺素，可以恢复足够的甲状腺激素水平，逆转甲状腺功能减退的症状和体征。
在治疗过程中需要注意的是，药物剂量要随着甲状腺功能检查结果的不同进行调整，不是用上药就一直按照这个剂量服用，一定要在用药后定期复查甲状腺功能。如果用药后甲状腺功能仍然不正常，需要增加药物剂量，如果用药后甲状腺功能恢复正常，也需要定期复查。
因为桥本甲状腺炎可能随着病情的延长，会对甲状腺进一步造成破坏，药物的剂量可能还需要增加、进行调整。部分人用药后会出现药物性甲亢的情况，就是激素量过大，根据甲状腺功能检查的结果，需要减少药物。所以用药中一定要严密监测甲状腺功能，进行药物剂量的调整。
