卵巢囊肿一般情况下首先要判断是生理性还是病理性，如果考虑生理性囊肿，该类囊肿也不大，一般在2-3cm左右，都小于5cm，此时不建议手术。如果大于5cm的囊肿，有时确定不了良恶程度，所以一般大于5cm的卵巢囊肿都要手术。
也有患者卵巢囊肿不大，在监测过程中，从2cm慢慢长到3cm，长到4cm，而且B超下汇报畸胎瘤或是巧克力囊肿，也有部分相应的症状，是否一定要等到5cm以后再手术，通常也不是，如果多次监测明确畸胎瘤，上述情况势必需要手术。
囊肿比较小时手术比较容易，对卵巢的损伤也比较小，此时会建议手术。但并不是只要发现囊肿就需要做手术，假如报1cm多的畸胎瘤，也不建议手术，一般情况下要长到3cm以上，确实为非生理性的囊肿，再考虑手术。
