激光治疗近视眼主要是削去角膜基质层。角膜组织最厚的部分叫角膜基质层，治疗近视眼削去的部位就在角膜基质层，瞳孔区域，大概直径在3-4mm之间的范围。

角膜主要是指眼球的黑眼珠，黑眼珠的厚度大概在0.5cm，一般分成5层。最表面的一层叫角膜上皮，角膜上皮的底下或者深部叫前弹力层，前弹力层的后边是角膜基质层，角膜的基质层到后面叫后弹力层，后弹力层最里面的叫角膜内皮。角膜厚度的90%是基质层，基质层是很规律排列的透明板层组织，激光削切角膜基质层的这些组织，削切一部分后，角膜上皮就会覆盖长入这个部分，对眼睛的影响很小。

眼睛由于角膜上皮或者前弹力层的覆盖，没有任何感觉，一般手术1-2个月以后，恢复正常。同时通过削切基质层改变眼睛角膜的屈光状态，通过光线的折射或者聚焦，原来的近视度数可以完全综合地治疗好。