转氨酶1000U/L以上并不一定是肝癌，转酶存在于肝细胞内，是反映肝细胞破坏的指标。无论是病毒性肝炎、药物性肝损伤、饮酒、脂肪肝，均可以引起转氨酶的明显升高。转氨酶升高程度与肝细胞受损相关，肝细胞受损越严重，转氨酶会越高。肝癌是肝脏恶性肿瘤，可以发生于慢性肝病基础之上，也可以无基础肝病。
肝癌早期并不一定会引起明显肝功能异常，即使较大肝癌，剩余肝脏功能尚且正常，也可以表现为肝功能正常。因此应避免根据转氨酶水平，诊断或排除肝癌，而应借助影像学检查、肿瘤标志物、病史、肿瘤病理学，从而确诊肝癌。肝癌治疗应结合肿瘤大小、数量、临床分期、肝功能，而选择不同的治疗方法。对于肝功能较差的患者，即使肿瘤较小，也无法通过外科手术进行切除。
