急性肾盂肾炎是泌尿系统感染的一种，属于上尿路感染，造成急性肾盂肾炎的病原微生物，大部分是革兰氏阴性杆菌，在绝大多数革兰氏阴性杆菌中，最常见的菌种就是大肠杆菌，即大肠埃希菌。

因为大肠杆菌来源于胃肠道，泌尿系统和胃肠道很近，如果胃肠道功能出现异常，如便秘、腹泻，大肠杆菌就会异常繁殖。其在胃肠道中是正常菌群，但是通过胃肠道的肠壁进入泌尿系统，或者通过胃肠道的排泄口、尿道口，逆行进入泌尿系统。

或者胃肠道造成炎症性病变，通过血液进入泌尿系统，都可能导致泌尿系统中急性肾盂肾炎的发作。

所以急性肾盂肾炎在没有做尿培养时，要根据经验来治疗。由于绝大多数是大肠杆菌引起，所以应用抗病原微生物药物时，要针对大肠杆菌等革兰氏阴性杆菌来进行治疗。同时患者要多喝水，以碱化尿液服用，并服用改善某些症状的药物。

如果尿培养，培养出来一些特殊细菌，需要根据药敏的结果来调整用药。