如果结石单纯位于肾脏之内，并未造成梗阻，也未合并感染，则患者没有临床症状。但是如果结石向下移动至肾盂输尿管连接部，或者向下掉入输尿管，造成输尿管梗阻伴发肾积水，患者则会出现腰腹部的剧烈疼痛，疼痛也可以放射至背部，同时伴有恶心、呕吐的症状。
一旦患者出现这些症状，应先进行止痛治疗，可以采用解痉药物，常用的药物包括心痛定、阿托品、654-2、黄体酮等。这些药物可以缓解输尿管平滑肌痉挛，帮助患者改善疼痛，如果疼痛改善不佳，可以配合强效镇痛药，如杜冷丁和吗啡进行治疗。如果疼痛仍然不能缓解，可以配合体外碎石或者采用急诊手术方法快速去除结石，以缓解疼痛。
