新生儿心脏有杂音建议尽快完善心脏彩超，明确心脏杂音是生理性杂音还是病理性杂音。如果心脏彩超提示心脏的结构和功能正常，这时出现的杂音可能会考虑是功能性的心脏杂音，不需要特殊的治疗，只需要定期随访和观察就可以。如果心脏彩超提示是器质性的心脏病，比如先天性的心脏病或者先天的心肌病所导致的心脏杂音，就要针对病因进行相关的处理。
如果是一个简单的先天性的心脏病，比如房间隔缺损、室间隔缺损、肺动脉狭窄或者动脉导管未闭等常见的先天性心脏病所导致的心脏杂音，如果在新生儿期也可以先对症的随访、观察。在幼儿期或者年龄大了一点，先天性心脏病没有自愈，或者先天心脏结构、功能异常越发严重的时候，可以采取进一步的手术治疗，包括介入手术或者开胸的手术。还有一些先天性心肌病，比如肥厚型心肌病或者扩张型心肌病，就要针对心肌病可能要酌情的给强心、利尿、扩管、营养心肌等对症的治疗和处理。
