脚底长肉刺是跖疣，治疗方法以外用药物和物理治疗为主，具体如下：

1、外用药物：包括维A酸乳膏、咪喹莫特霜，维A酸乳膏为角质剥脱剂，但单独使用的疗效欠佳。若为顽固性跖疣，可将平阳霉素用普鲁卡因稀释后注入在疣体根部，效果较好；

2、物理治疗：包括液氮冷冻、电灼、刮除、二氧化碳激光、光动力治疗等。光动力治疗效果较好，但治疗成本较高，在其他治疗效果欠佳时可选用。