尿中有形物质析出而形成结晶，结晶进一步发展为结石。结石本身就是由晶体和基质构成，97%为晶体，3%为基质。根据晶体的不同，把结石分为含钙结石、感染性结石、胱氨酸结石以及尿酸结石。结石的成分可以单一，也可以复合。
而结石发生的病因非常复杂，通常把病因分为外界因素、个体因素、泌尿系统因素以及尿液成石因素。通常是在前三者的作用下，导致尿液中的成石因素增强，抑制因素减弱，尿中有形成分析出。
析出物最早是晶体，逐步进展就成为了结石。尿液的酸碱度不同，其析出的晶体也不尽相同。在碱性尿当中，容易析出的结晶是磷酸钙结晶、碳酸钙结晶及尿酸钙结晶。
而在酸性尿当中，容易析出的结晶是尿酸结晶、胆固醇结晶、胱氨酸结晶、酪氨酸结晶、草酸钙结晶、磺胺结晶等。所以在临床工作中，可以根据结石的成分不同，采取碱化尿液或者酸化尿液来处理结石。
