甲钴胺不能用来治疗植物神经功能紊乱，这是误区。甲钴胺原则上不治疗功能紊乱性疾病，主要的功效是治疗周围神经病变，比如糖尿病周围神经病变，起到营养神经、促进神经再生的作用。
比如尺神经损伤引起的鹰爪手，或者桡神经损伤引起的垂腕，或者正中神经导致的腕管综合征，甲钴胺对此有一定疗效。对于代谢因素，如维生素B12缺乏性周围神经病，甲钴胺效果较好。而对于其他疾病，效果并不好。
对中枢系统，如脑中风、脑部病变如脑肿瘤，没有明显疗效。对于功能紊乱性疾病，所谓的植物神经功能紊乱实际是神经症，躯体形式障碍或者神经衰弱等疾病，不推荐用维生素治疗。
甲钴胺主要起安慰剂的作用，本身并不治疗植物神经紊乱。想要治疗这类疾病，要选择正规的抗焦虑、抑郁药物，中成药物也可以选择，甲钴胺并不推荐。
