胃食管反流的药物治疗，主要是抑酸药物、促动力药、胃黏膜保护剂等，具体如下：

1、抑酸药物：是治疗的基础，常用的药物包括质子泵抑制剂，例如雷贝拉唑、泮托拉唑、奥美拉唑、兰索拉唑等。这类质子泵抑制剂，主要通过作用于泌酸壁细胞的氢-钾-ATP酶，减少胃酸分泌。由于胃食管反流，主要是胃酸反流至食管，引起的相关症状。典型的症状为烧心、反流，尤其是反酸，所以抑酸是治疗的基础。目前也有新型的抑酸药物，例如P-CAB类的伏诺拉生，可以起到抑制胃酸反流的作用。以前可能还应用H₂受体拮抗剂，例如法莫替丁、雷尼替丁，同样能够起到抑制胃酸的作用；

2、促动力药：目前临床实践证明，合用促动力药物，可以加强胃食管反流的治疗效果。由于胃食管反流病，同时也存在动力障碍；

3、胃黏膜保护剂：如果患者黏膜损伤比较严重，可能还会同时加用胃黏膜保护剂，例如铝碳酸镁咀嚼片等。可以起到中和胃酸的作用，快速缓解症状，有助于促进黏膜愈合。