若为单纯的肌间静脉血栓，没有长期卧床，引起血栓的原因能够消除掉，常用药1-2周左右可以消失，但应注意，此类情况为其他部位没有血栓。
因常诊断肌间静脉血栓，是通过下肢静脉的超声进行诊断。下肢静脉的超声，只能诊断髋关节、腹股沟以下水平的静脉血栓，对盆腔和腹腔里的髂静脉、下腔静脉里的血栓，超声无法观察到。若只是超声发现肌间静脉血栓，实际上，下腔静脉、髂静脉血栓，单纯的抗凝，可能较长时间，亦不能治疗彻底，或无法消掉。
肌间静脉血栓消除的时间还与伴随的疾病有关，如骨科手术后的患者，虽肌间静脉血栓，在抗凝、服用药物，但依然不能下床，没有活动量。包括肿瘤的患者，本身就是血栓的高危因素。
包括一些病情较重的患者，服用激素的患者，急危重症、神志不清、气管插管的患者。静脉血栓的治疗，单纯通过抗凝打通血管，可能较为困难。
