抗血栓的药物总体可分为抗凝药物、抗血小板药物、溶栓药物。抗凝药物从种类上而言，首先有早期的普通肝素和经典的口服药物华法林，其次有低分子肝素，使用后无需进行监测，然后有新型口服抗凝药中为代表的利伐沙班等。
抗血小板药物主要包括拜阿司匹灵、波立维、贝前列素钠片等。抗凝、抗血栓和抗血小板存在区别，在预防静脉血栓时常常使用抗凝药物，预防动脉血栓时，常使用抗血小板药物。一旦诊断血栓，无论是动脉血栓还是静脉血栓，往往需要使用抗凝药物。
另外，溶栓药物，如尿激素、链激素，尿激酶的抗栓效果可能比抗凝药更快，但出血风险较大，使用后往往需要在医院由血管外科医生监测，通过下腔静脉滤器、置管溶栓，增加溶栓效果，降低溶栓出血的风险。此外，还有一类抗血栓的辅助用药，如川芎嗪等。
