经皮肾镜碎石取石通常为处理肾脏较大结石采用的方法，在结石手术中属于创伤相对大的手术。即从肾脏后方区域打孔进入，经皮肤到达肾脏结石所在部位，建立通道后放鞘，通过鞘放入操作工具，如肾镜、碎石杆，结石打碎后通过鞘吸出或冲出结石。其与开放手术相比，属于创伤非常小的手术。经皮肾镜对手术要求较高，通常相对较大的医院才会开展。

该手术主要风险可能为较易出现出血，如果出现动脉性出血则是比较严重的情况，需进行介入栓塞，其次还有感染的风险性。尽管可能存在一定的风险和意外，但目前为止还是处理肾内较大结石最好方法，为金标准。经皮肾镜手术存在逐渐发展的过程，国内已经有20多年的开展历史，目前已经非常成熟。可以根据病人不同的结石大小、不同部位选取不同的方法，碎石的工具也非常丰富，可应用激光碎石、气压弹道碎石、超声碎石负压吸引，还可以联合如输尿管软镜等工具，处理更加复杂的结石。