肾小管空泡变性是否严重，主要还是需要根据引起肾小管上皮细胞空泡变性的原因来进行分析，具体如下：

1、不严重：在一些大量蛋白尿的患者中，比如肾病综合征患者，由于肾小管上皮细胞对肾小球滤出的蛋白尿进行回吸收，出现蛋白尿的现象，如果蛋白尿量比较大，那么小管上皮细胞会出现空泡变性，随之肾小管上皮细胞的功能也会受到影响，做化验检查就可以观察到一些反应近端肾小管功能的指标，比如尿ɑ1微球蛋白、尿视黄醇结合蛋白，会有轻度的升高；

2、严重：一些药物或毒物引起的肾小管上皮功能损伤，导致肾小管上皮细胞空泡变性，这个情况有可能会比较严重，可能是由于肾小管上皮细胞的功能在去除诱因以后，也没有完全恢复导致。比如肾病综合征的患者在有一些基层医院，由于患者有低白蛋白血症，有一些医生给患者使用比较多的血浆代用品，比如不断输注大量的血浆白蛋白，那么此时也会导致患者出现渗透性肾病，表现为肾小管的上皮细胞出现空泡变性，这种情况有的时候，患者很长时间或者是持续的肾小管上皮细胞的功能不能恢复，甚至会有肾功能的进一步的进展，出现血肌酐水平持续的增高。