试管移植两个为什么只成功一个，最根本的因素，就是移植的两个胚胎质量不同，好的胚胎就成功，坏的胚胎就淘汰，这是最简单的最直接的因素。

试管婴儿移植成功的关键要素，或者影响试管婴儿移植成功的最重要的因素，第一胚胎的分化潜能，就是胚胎的质量；第二子宫内膜的容受性，就是子宫内膜要适合于受精卵的着床和发育；第三机体的免疫环境。如果有抗精子抗体、抗磷脂抗体、免疫疾病，对于移植的受精卵会有免疫的排斥作用，从而使得移植失败。还有体内的内分泌环境，包括雌孕激素的水平、垂体-下丘脑-卵巢轴的调节功能。这些功能还受睡眠、情绪、环境因素等多重因素的影响。

同时植入两个受精卵，内分泌环境、免疫环境、子宫内膜的容受性处在同样的水平，为什么一个成功一个失败，显然受精卵的质量不一样。所以，胚胎的质量不一样导致结局完全不同。因此会出现一个好一个坏，好的胚胎就成功，坏的胚胎就失败。