甲沟炎化脓了，往往药物控制不佳，需要手术沿着甲沟旁，纵行切开脓肿，引流脓液。甲根处形成脓肿的时候，一般建议要行拔甲术，拔指甲以后，可以减少指甲对甲沟的刺激，能够使炎症逐渐消退，而且恢复得也比较快。
拔甲之后可以将脓液彻底的引流干净，有助于恢复。做完手术以后，伤口一般一定要定期消毒，要用碘伏消毒。碘伏具有杀菌作用，可以防止感染，而且碘伏对组织的刺激性比较小，不会影响创面的愈合，患者一般也不会感觉到非常的疼痛。
可以配合药物治疗，包括外用的消炎，促进伤口愈合的药膏，配合抗生素，有利于感染快速控制。甲沟炎一般情况下，如果甲床没有被破坏，即使拔甲，后期再长出指甲，不会受到影响。
还有一种关于甲沟炎的排脓，现在临床也不一定都切开，而是直接顺着甲沟的炎症或者细菌的切入点，就可以把脓排出来。
