婴儿脑积水的最佳治疗时间，取决于其临床症状。具体情况如下：

1、病情较重：如果脑积水比较严重，已经严重地压迫脑组织，导致婴儿脑功能出现严重障碍，引起智力下降、运动发育迟缓，或者听力、视力，以及其他神经系统功能障碍。这种情况下，一般建议越早手术越好。因为对于小的婴儿而言，三岁之内是中枢神经系统发育最高峰的时间，如果在这个阶段，脑积水压迫脑组织，影响中枢神经系统的发育，有可能会对婴儿造成不可逆的智力、运动以及听力，还有语言表达能力的障碍；

2、症状明显：如果婴儿明显地出现脑组织受压迫的临床症状，在发现有症状的时候，需要尽早解除脑积水的症状，这样才能在短时间内解除对脑组织的压迫，尽可能减轻对脑细胞的损害，降低致残的几率；

3、良性脑积水：部分婴儿是外部性脑积水，称之为良性脑积水，这种情况并不影响婴儿的智力，以及大运动的发育，就不需要给予手术或者药物干预。一般定期复查，大多数婴儿可以自行恢复至正常。