肝功能检查不能查出肝癌，只能反映出细胞有无损伤，以及肝脏的功能能否满足机体的需要。上述两方面没有问题，肝脏功能可以显示正常，但并不能反映身体有没有疾病。肝癌是肝内组织细胞突变以后形成的肿瘤，在肝癌早期，肝脏功能几乎不会有任何的影响。由于肝脏代偿功能较为强大，所以早期肝癌的患者，肝功能可以表现为完全正常。
当肝功能出现异常时，可能是其他疾病导致，如肝炎、药物性肝损伤、酒精性肝损伤等，不一定是肝癌。真正的肝癌患者到中晚期的时候，才会对机体产生明显的影响，若是通过肝功能不良发现肿瘤，往往已经错失肿瘤治疗的最佳时机。肝功能仅仅能够反映出肝脏自身的功能，包括解毒、合成、凝血因子的产生等，并不足以反映身体其他的相关疾病，除非疾病严重到对肝功能产生影响，才能够从肝功能检测中得到启示或线索。
