双肾多发囊肿代表双肾有很多囊肿，往往由膨大的肾小管憩室构成，会逐渐增大。如果单侧肾囊肿超过3个，逐渐增大以后，可能会对肾脏形态、功能造成影响，＞5cm的时候，也容易对肾脏造成影响。另外，如果囊肿向内生长，也有可能会挤压到肾脏实质，导致肾脏出现异常。
如果遇到以上情况，通常会选择手术治疗，手术治疗常用抽液、打固化剂。另外，针对具体情况选择去顶减压术。如果双肾多发囊肿比较复杂，甚至怀疑囊性肾癌的囊肿，会考虑囊肿切除术。如果双肾多发囊肿是多囊肾，可能会逐渐向前进展，会逐渐发展为肾功能不全，甚至是尿毒症。
