头很痛但是做了脑CT又显示正常，有如下几种情况：

1、功能性因素或者原发性头痛，如焦虑、抑郁、情绪不好引起的继发性头痛，原发性头痛像偏头痛、丛集性头痛、紧张性头痛、三叉自主性头痛，这些疾病都没有病灶，做CT、磁共振都是正常的。因为上述疾病不是恶性肿瘤，血管也没有堵塞，也没有炎性损害，自然做影像学检查没有问题，这时经过医生诊断，如果是焦虑、抑郁引起，或者原发性头痛，不必特别担心，也有相关的药物进行治疗，不是所有的头痛，都一定能看到病灶。

2、脑部存在疾病，但是CT检查不出来，这些器质性疾病如脑炎、脑膜脑炎，进行CT检查就是看不到病灶，即使做了磁共振，有些病灶也不太明显，做增强CT才有可能会看到脑膜有点强化、增厚，腰穿脑脊液是有异常的，压力是升高的。

3、其他器质性疾病，比如可逆性脑血管收缩综合征和高血压性脑病继发的头痛，这些在影像学上也没有明确发现，CT由于分辨率有限，也没有特别多的序列，对这些疾病的诊断都是不利的，如果做了磁共振还有血管成像，诊断率就会更高。

所以具体问题要具体分析，需要到神经科就诊做进一步的筛查。