光子嫩肤安全性比较高，主要是利用高能量强度的脉冲光治疗皮肤疾病。具有适应症比较广的特点，但前提条件是在正规的医疗美容机构，由经验丰富的医生操作，才能使危害或者风险降到最低。副作用主要是治疗时局部会有轻度的红、痛等刺激症状，治疗之后可能会出现暂时性色素沉着，通常随着时间延长可以逐渐消退，10年以后光子嫩肤的这些危害通常可以消失。
如果选择的适应症不合适，比如黄褐斑，使用光子嫩肤，能量过大可以使黄褐斑加重。局部有明显的黑素细胞痣，反复用光子嫩肤治疗，不排除会对痣细胞产生刺激，诱发恶变。如果是光敏性皮肤或服用了光敏感药物，使用光子嫩肤有可能造成光敏性皮炎。
