患者可通过抗乙肝病毒治疗使乙肝病毒数量下降，目前抗乙肝病毒治疗方法包括口服药和肌肉注射干扰素。一线口服药有恩替卡韦、替诺福韦、丙酚替诺福韦等，临床疗效较好。通常患者在用药后可使HBV-DNA下降，但需在专业医生指导下应用，一旦用药便需长期服用而不可随意停药。

干扰素需通过肌肉注射且具有一定副作用和不良反应，也需在专科医生指导下用药。上述药物仅具有抑制病毒功效而无法消灭病毒，因此患者需长期服用。根据2019年版慢乙肝治疗方案显示，表面抗原阳性患者需检查HBV-DNA，若DNA为阳性则需参考DALT水平，即谷丙转氨酶水平，一旦该数值超出正常范围，患者便需进行抗病毒治疗。

对于部分患者出现表面抗原阳性时无需检查DNA值，便要进行抗病毒治疗，此类患者包括已经出现肝功能衰竭、肝功能失代偿及肝癌情况，此时患者要进行免疫制剂治疗、丙肝治疗。另外，如果患者在30岁以上且存在肝炎、肝硬化、肝癌家族史，即便肝功能正常也需进行治疗，还需进行肝穿或肝纤维化检测，一旦达到二期及以上，也需进行抗病毒治疗。此外，如果患者确诊为肝硬化，无论肝功能水平如何，DNA呈阳性即需治疗，建议患者听从专科医生指导进行。