通常在前列腺液检查中，看到满视野的白细胞或红细胞，可以诊断为有菌性前列腺。根据既往的临床试验和科学报告，主要是大肠杆菌、金黄色葡萄球菌、变形杆菌等常见的尿路感染菌，即前列腺炎大多是从尿道感染而来。在治疗上，需要用能够覆盖此类细菌的抗生素治疗，可以选用喹诺酮类药物，如左氧氟沙星。因为喹诺酮类药物能覆盖男生殖器感染的常见细菌，而且其高效低毒，副作用相对较低，但在前列腺内药物浓度较高。
如果患者＜18岁，可以选用头孢克洛。若患者前列腺炎持续时间较长，则要怀疑可能为耐药性前列腺炎，可以先根据经验，选用耐药机会比较低的抗生素，如磷霉素治疗。针对此类慢性有菌前列腺炎，建议进行前列腺液或者精液的细菌培养，还有药物敏感试验。然后根据试验结果来调整用药，往往会有较好的治疗效果。
