小儿吸入麻醉的副作用其实是全身麻醉中的一种，吸入麻醉药有可能会造成患儿恶心、呕吐的情况，可能会比静脉麻醉更高。有些小孩可能对吸入药有反应，可能会引起烦躁、过敏。有些患者可能会出现恶性高热，吸入麻醉药造成恶性高热的可能性，比静脉麻醉造成恶性高热的可能性高。但如果基因好，基本上没有太大问题。
吸入麻醉的缺点在于恶心、呕吐的可能性比静脉麻醉更高，结束麻醉之后患儿烦躁的可能性更高。但在整个过程中，医生会按照小孩的情况进行调控，可以用吸入，也可以用静脉，也可以用静吸复合，保证小儿麻醉手术顺利进行，保证小儿手术过程中的舒适，让副作用更少，舒适度更高。
