耳洞被脓堵住后，通常可以用负压吸引将外耳道的脓性分泌物吸出，从而能够观察到外耳道和中耳的情况。如果是外耳道炎引起的脓性分泌物，在清理干净后，可以用抗生素滴耳液进行滴耳，或者用抗生素软膏进行涂抹，也可以加用抗生素进行口服。
如果中耳炎患者鼓膜有穿孔，对于中耳炎症引起的脓性分泌物，需要给予抗生素口服，如头孢类、阿奇霉素类或喹诺酮类药物。同时还用双氧水清理外耳道以及用抗生素滴耳液进行滴耳。如果耳朵内经常有多量的脓性分泌物堵塞，需要进行耳部的CT检查，了解中耳炎症的侵犯范围以及是否有胆脂瘤。如果有胆脂瘤侵犯，还应行手术治疗。通常手术是在全麻下进行，通过耳内窥镜或手术显微镜将胆脂瘤进行切除。
