肛瘘有多种手术方法，但是不管哪种手术方法，都要把内口和外口之间瘘管切除掉挂线或者手术切除。尤其是肛瘘比较严重时候，内口和外口较远时候即瘘管较长的时候，手术以后可能在肛门边缘形成沟，挂线或者切开。部分括约肌切断愈合以后形成豁口，有时候豁口会逐渐变浅，但是不会完全长严，一般不会影响到正常生理功能，但是能看到肛门旁边有沟。
肛门是个大圆，旁边有个小豁口，豁口可能不会长圆，尤其对严重肛瘘或者高位肛瘘或者挂线治疗，后遗症即肛门边上有缺口，缺口不能长上。如果肛门旁边离肛门好远有小洞，那时候应该长上，如果长不上等于还是肛瘘，等于手术不成功，没有治好。所以肛门旁边小洞即肛门旁边术后有豁口，好长时间没有长上，不会再长严，而且一般不影响功能，可能会有轻度肛门失禁，排便出现稀便，还会有肛门潮湿，也是肛瘘术后的并发症，没有办法解决。
