做肠镜有可能会引起尿路感染。肠镜检查前需禁食或少渣饮食，减少肠便产生，另外可能需要口服泻药，腹泻后肛门口细菌可能会影响会阴部。尤其女性会阴周边有阴道、尿道，可能会逆行感染进入尿道、膀胱，引起尿路感染。临床上尿路感染通常表现为尿频、尿急、尿痛，甚至可能会有小便出血、腰背酸痛、发烧的情况。如果有尿路感染，需要通过多喝水利尿的方式，促使尿液中细菌排出，不能因为害怕小便痛、出血，就减少小便量、少喝水。
另外要注意个人卫生、会阴部护理，可以通过妇炎洁洗剂、碘伏擦洗、勤换内裤等方式局部消毒。男性患者要注意改变饮食结构，不能喝酒，不能食用刺激、辛辣、海鲜类食物。此外要注意休息，保证充足睡眠、放松心态。同时也可以服用中成类药物，如泌淋清、癃闭舒，改善局部炎症、缓解尿路感染的情况。
