脑脊液蛋白含量高，在大多数情况下可以治疗、可以调控，甚至可以治愈。只有一小部分情况，脑蛋白的升高不好治疗。首先了解引起脑脊液蛋白升高的病因是什么，如果是脑炎继发脑脊液蛋白升高，以及脑出血导致的脑脊液蛋白升高，通常可以调控、可以治疗。
可以采取的治疗办法包括治疗原发病，以及应用小量皮质激素降低脑脊液蛋白，定期做腰穿放液，进行脑脊液置换，这些都是比较好的办法。通过综合调理的办法，相当一部分脑炎和脑出血患者的脑脊液蛋白升高可以得到控制、降下来。
脑脊液蛋白升高不好治，最常见于脑部的恶性肿瘤，尤其是其他部位的肿瘤转移到脑室里面，形成脑膜转移，这个时候蛋白升高会非常明显。
由于恶性肿瘤本身非常难治，目前则是延长生存时间，非常难以根治。所以这类疾病脑脊液蛋白升高，即使短时间得到控制，长此以往也不太好控制。
